اگرچه هر دو MOC و MOF حاوی پیوندهای هماهنگی آلی{0} فلزی هستند، تفاوتهای اساسی وجود دارد:
ابعاد: MOC ها مولکول های گسسته صفر بعدی هستند، در حالی که MOF ها شبکه های دوبعدی یا سه بعدی بی نهایت گسترده هستند.
حلالیت: اکثر MOC ها محلول هستند، در حالی که MOF ها به طور کلی نامحلول هستند.
پایداری: MOF ها به طور کلی پایداری حرارتی بالاتری دارند.
تمرکز برنامه: MOC ها در تشخیص مولکولی برتری دارند، در حالی که MOF ها برای ذخیره سازی گاز مناسب تر هستند.